Факультет биотехнологий и агрономии образован после реорганизации структурных подразделений ФГБОУ ВПО ЧГСХА в сентябре 2014 года на базе биотехнологического факультета путем присоединения к нему агрономического факультета и передачи факультету ветеринарной медицины и зоотехнии направления подготовки 36.03.02 - «Зоотехния».
На сегодняшний день факультет биотехнологий и агрономии - это одно из самых крупных подразделений академии, объединяющее в своем составе 3 кафедры, а также одну тысячу студентов очной и заочной форм обучения.
Факультет возглавляет кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Ложкин Александр Геннадьевич.
Специалистами по учебно-методической работе факультета являются:
- Ковшова Арина Вадимовна – по очному отделению;
- Сусликова Алена Евгеньевна – по заочному отделению.
Факультет биотехнологий и агрономии готовит специалистов и бакалавров по трем направлениям подготовки:
-35.03.07 – «Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции»;
- 35.03.04 – «Агрономия»;
- 21.03.02 – «Землеустройство и кадастры».

Подготовкой студентов по данным направлениям осуществляют три кафедры, которые являются выпускающими:
- «Биотехнологий и переработки сельскохозяйственной продукции» (заведующий - кандидат биологических наук, доцент Мардарьева Наталия Валерьевна);
- «Земледелия, растениеводства, селекции и семеноводства (заведующий - кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Елисеева Людмила Валерьевна);
- «Землеустройства, кадастров и экологии» (заведующий - кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Чернов Александр Владимирович).